Snabbstart — rita din första molekyl
Klicka på kol-knappen (eller tryck C) i Ketchers vänstra verktygsfält.
Klicka i ritytan — en metan (CH₄) dyker upp (vätena är dolda men finns).
Klicka på en av väteanslutningarna för att lägga till en till kolatom. Fortsätt så för en kolkedja.
Vill du ha en bensenring ? Klicka på sexkant-ikonen (eller tryck 5) och placera den.
Klicka 🔍 Sök lokalt i höger sidopanel när du är klar.
SMILES-strängen uppdateras live under ritytan medan du jobbar.
Verktygsfältet — vad gör knapparna
Ketchers verktygsfält ligger längst till vänster. Grupperat uppifrån:
Markera / flytta — pilen (eller Esc). Klicka och dra för att markera, flytta atomer/grupper.
Radera — sopkvasten (eller Del). Klicka på atom/bindning för att ta bort.
Bindningstyper — enkel, dubbel, trippel, aromatisk, stereo (kil upp/ner). Klicka först på typen, sedan på en bindning för att ändra den. Genvägar: 1, 2, 3.
Atomer — kol är default. Klicka på en annan grundämnesknapp (H, O, N, S, P, F, Cl, Br, I) eller öppna periodiska systemet för fler. Genvägar: C, O, N, S, H.
Ringar (mall) — bensen (sexring m. dubbelbindningar), cyklohexan, cyklopentan m.fl. Klicka på en ring först, sedan i ritytan eller ovanpå en befintlig atom för att fusera.
Funktionella mallar — t.ex. karboxylsyra, ester, sulfonamid. Snabbsätt för vanliga grupper.
Laddning / radikaler — +, −, prickar för radikaler.
R-grupper / abbreviationer — för att rita generiska substituenter (R₁, R₂…).
Atomer — så lägger du till specifika grundämnen
Vanliga atomer finns som knappar i verktygsfältet — klicka på t.ex. O och sedan i ritytan.
Ovanliga atomer : klicka på "Periodiskt system" eller tryck A för atomdialogen — välj fritt grundämne.
Byt atom på en befintlig position : dubbelklicka på atomen → ändra symbol → OK.
Implicita väten visas inte men finns automatiskt. Vill du visa dem: Visa → Visa väten i Ketchers meny.
Isotoper : dubbelklicka atomen → ange massa i "Isotop"-fältet (t.ex. 13 för ¹³C).
Bindningar — typer och stereokemi
Klicka på en bindning medan en bindningstyp är vald → ändrar typ.
Cykla typer : klicka upprepade gånger på samma bindning (enkel → dubbel → trippel → enkel).
Stereokemi — kil-bindningar (▲/▽) visar att en grupp pekar upp/ner från planet (3D-info i 2D-bild). Viktigt för kirala centra.
Cis/trans (E/Z) — ritas naturligt genom hur dubbelbindningens substituenter placeras.
Aromatiska ringar : använd antingen bensen-mallen eller rita en alternerande enkel/dubbel-mönster. Ketcher tolkar båda korrekt.
Ringar och mallar
Bensen (sexring m. dubbelbindningar): klicka på bensen-ikonen, sedan i ritytan.
Fusionera ringar : med bensen vald, klicka på en befintlig bindning eller atom → ringen fogas på.
Anpassad ringstorlek : håll musen över ring-ikonen för meny med 3–8-ringar, eller använd "Custom Ring" .
Heteroringar (pyridin, furan, tiofen): efter att ha placerat en kolring, byt rätt atom via dubbelklick.
Markera, kopiera, flytta
Markera fragment : pilverktyget + drag-ruta runt atomer.
Markera allt : Ctrl/⌘ + A.
Kopiera / klipp / klistra : standard Ctrl/⌘ + C/X/V.
Rotera markering : Ctrl/⌘ + drag i markeringen.
Ångra/gör om : Ctrl/⌘ + Z / Ctrl/⌘ + Y.
Importera och exportera
Klistra in SMILES eller MOL : File → Paste from clipboard . Ketcher parsar automatiskt format.
Öppna fil : File → Open — stöd för MOL, RXN, SMILES, InChI, CML m.fl.
Spara : File → Save As — välj format. SMILES är minst och mest portabel.
Snabb-genväg : ritningen sparas automatiskt i webbläsaren och återställs nästa gång du öppnar sidan (även vid språkbyte).
Tips och vanliga problem
"Inget händer när jag klickar" — kontrollera att rätt verktyg är aktivt i vänsterpanelen (markerad knapp lyser blå).
Felaktig bindningstyp — klicka på bindningstypen i verktygsfältet först, sedan på bindningen.
Två atomer hänger inte ihop — markera båda → välj bindningstyp → klicka mellan dem.
"Rensa ritytan" -knappen i höger sidopanel tömmer allt och börjar om.
Mer Ketcher-hjälp : EPAM Ketchers officiella docs .
Efter att du ritat — så slår appen upp ämnet
När du klickar Sök lokalt beräknas en InChIKey (strukturhash) som
jämförs mot databasen:
Exakt träff — hela InChIKey matchar inkl. stereokemi/isotoper/laddning. "Samma" ämne.
Skelett-träff — bara de första 14 tecknen matchar (samma konnektivitet, möjlig skillnad i stereo).
Ingen träff — möjlighet att söka PubChem online.
Resultatkortet visar då SvSID, CAS, namn, faroklassning (Annex VI + ECHA C&L), fysikaliska
egenskaper och knappen Visa 3D om lokala 3D-koordinater finns.
Hovra över badges och taggar för att se vad de betyder.